甘薯贮藏期的管理主要是根据安全贮藏的条件，调节内窖内的温度、湿度，其中温度是主要条件。
一、前期以降温排湿为主
从种薯入窖至小雪，窖内温度较高，薯块处于呼吸旺盛期，散发出大量的水气、二氧化碳和热量，应注意降温、通风散湿、不盖窖口、控制温度在12---15℃左右，相对湿度在80%—90%为宜，测试薯堆温度应测试薯堆内部，测的时间在中午。
二、中期以防寒保温为主
从小雪到立春，窖内温度较低，薯块呼吸作用减弱，产生热量少，管理要点是防寒、保温、保湿。当薯堆内温度降到15℃左右，要加强覆盖，挂好门帘堵严同气口。必要是在窖顶加盖干草，加厚土层，保持10—12℃的堆温，相对湿度在85%左右，贮藏中期测试湿度应在薯堆外部，测的时间在早晚。
三、后期以稳定窖温为主
从2月下旬到出窖，窖外温度逐渐回升，但经常有寒流，气温变化，薯块经长期贮藏、呼吸微弱、经不住窖温过大变化，故以稳定窖温为主。窖温应维持在12--15℃。保持相对湿度在85%左右。湿度过大时，选晴天中午，大气温高于11℃时通风散湿。